Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd11P23813 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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