Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd11P23813 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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