Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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