Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxd11P23813 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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