Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Gm379J3QQ19 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Gm379J3QQ19 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms