Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Mir297-1-201ENSMUST00000103800 76 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Gm3250E9Q1M3 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Gm3250E9Q1M3 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Gm3250E9Q1M3 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Gm3250E9Q1M3 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Gm3250E9Q1M3 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Gm3250E9Q1M3 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Gm3250E9Q1M3 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Gm3250E9Q1M3 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Gm3250E9Q1M3 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms