Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Sh3bp1P55194 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sh3bp1P55194 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms