Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Cldn4O35054 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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