Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn2r25W4VSP2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn2r25W4VSP2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms