Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17190V9GX38 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17190V9GX38 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17190V9GX38 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17190V9GX38 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17190V9GX38 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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