Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top3bQ9Z321 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top3bQ9Z321 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms