Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac6Q9Z2V5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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