Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn6Q9Z262 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cldn6Q9Z262 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn6Q9Z262 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn6Q9Z262 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms