Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms