Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs4Q9Z1T2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms