Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shcbp1Q9Z179 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Shcbp1Q9Z179 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms