Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ror1Q9Z139 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ror1Q9Z139 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms