Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb6Q9Z0T9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms