Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Cldn13Q9Z0S4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Cldn13Q9Z0S4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cldn13Q9Z0S4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn13Q9Z0S4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms