Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ChrdQ9Z0E2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms