Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nme3Q9WV85 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nme3Q9WV85 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms