Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms