Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stub1Q9WUD1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms