Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms