Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp18Q9WTV6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Usp18Q9WTV6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp18Q9WTV6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp18Q9WTV6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms