Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spo11Q9WTK8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spo11Q9WTK8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms