Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpc2Q9R244 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms