Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms