Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubd1Q9R1K7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubd1Q9R1K7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms