Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrg1Q9R0Y8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms