Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Plod2Q9R0B9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms