Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms