Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AmfrQ9R049 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AmfrQ9R049 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms