Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col4a3Q9QZS0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms