Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM0

Ubqln2, Ubiquilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln2Q9QZM0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubqln2Q9QZM0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms