Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ercc4Q9QZD4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ercc4Q9QZD4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms