Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn8Q9QZ49 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn8Q9QZ49 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms