Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms