Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nufip1Q9QXX8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms