Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk1nQ9QXV0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms