Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcnip3Q9QXT8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnip3Q9QXT8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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