Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trip4Q9QXN3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trip4Q9QXN3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms