Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trp53inp1Q9QXE4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trp53inp1Q9QXE4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms