Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lsm4Q9QXA5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lsm4Q9QXA5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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