Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma6Q9QUM9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma6Q9QUM9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma6Q9QUM9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma6Q9QUM9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma6Q9QUM9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma6Q9QUM9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma6Q9QUM9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma6Q9QUM9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma6Q9QUM9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms