Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csnk1eQ9JMK2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csnk1eQ9JMK2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms