Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Reep6Q9JM62 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep6Q9JM62 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep6Q9JM62 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms