Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pias4Q9JM05 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms