Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd2l2Q9JLG4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd2l2Q9JLG4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms