Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nectin3Q9JLB9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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